Il wipe cache non cancella niente. Cmq quello che ti consiglio, se vuoi passare alla v6, è prima di tutto installare l'update (la 4.11.7, non le altre mi raccomando). Poi, a telefono riavviato, rifai l'aggiornamento. Quando si riavvia ancora, spegni. Poi riaccendi in recovery e fai un wipe cache (ci mette molto tempo, non toccare niente). Alla fine avrai la v6 su entrambi i system e tutti i tuoi dati e app.
N. B. Il doppio update si fa solo una volta. Ti consiglio di fare un wipe cache una volta al mese